Warp Frontier транспортирует игрока в будущее – в 2215 год. Винсент, капитан полиции, оказывается запутанным в заговоре между системами, нацеленным на полное устранение преступлений, совершенных во время войны. Предшествующий конфликт разорил его родной мир, уничтожил близких ему людей и значительную часть населения. Винсент – главный герой и отмеченный участник предыдущей войны. Будучи капитаном полиции, он патрулирует между орбитальными станциями-трущобами, расположенными рядом с его родной планетой Цетус. Однажды он проводит расследование преступления и находит следы загадочного исчезновения тысяч людей, включая свою первую жену и лучшего друга. Главный герой объединяется с роботом-партнером по имени МАК и вместе им придется взаимодействовать с не самыми надежными персонажами, чтобы остановить старого врага, который по-прежнему совершает противозаконные действия.